Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms