Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms