Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFRP1Q8N474 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms