Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms