Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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