Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms