Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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