Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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