Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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