Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms