Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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