Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms