Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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