Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms