Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms