Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POU5F1Q01860 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms