Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms