Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms