Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMF1P82094 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMF1P82094 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMF1P82094 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMF1P82094 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms