Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BACE1P56817 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BACE1P56817 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BACE1P56817 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BACE1P56817 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BACE1P56817 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BACE1P56817 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BACE1P56817 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BACE1P56817 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BACE1P56817 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BACE1P56817 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BACE1P56817 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BACE1P56817 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BACE1P56817 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BACE1P56817 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BACE1P56817 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms