Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP1P29466 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP1P29466 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP1P29466 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP1P29466 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms