Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DESP17661 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms