Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms