Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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