Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM38O00635 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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