Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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