Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms