Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms