Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHMP4AQ9BY43 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHMP4AQ9BY43 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms