Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM139Q8IV31 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM139Q8IV31 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms