Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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