Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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