Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ECM1Q16610 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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ECM1Q16610 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ECM1Q16610 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ECM1Q16610 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ECM1Q16610 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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