Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SSX1Q16384 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SSX1Q16384 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SSX1Q16384 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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