Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms