Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CAMK2DQ13557 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms