Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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