Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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