Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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FOXD4Q12950 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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FOXD4Q12950 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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FOXD4Q12950 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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FOXD4Q12950 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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FOXD4Q12950 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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FOXD4Q12950 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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FOXD4Q12950 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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FOXD4Q12950 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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