Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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