Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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