Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms