Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms