Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms