Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HBBP68871 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms