Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms