Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms