Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPARGP37231 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPARGP37231 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGP37231 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGP37231 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms