Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF1P30408 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms