Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms